Ағымдағы маусымға дейін ескерткіш ғылыми айналымға енбеген. Биыл зерттеушілер цитадельге назар аударды, онда қорғаныс қабырғалары мен мұнаралардың қалдықтары тазартылды.
Табылған заттардың ішінде — хумдар, құмыралар, тостағандар, шамдар және ыдыс-аяқтағы ою-өрнекке арналған сүйек құралдар. Ескерткіште алғаш рет археоботаникалық зерттеулер жүргізілді: ошақтар мен шұңқырлардан алынған үлгілерді Германиядан келген маман Кристиан Лейппен бірге флотация әдісімен зерттеуде.
Лейпп оның климаттың өзгеруіне адамдар қалай әрекет еткені және қандай өсімдіктерді тұтынғаны мен өсіргені қызықтыратынын айтты. Осы мақсатта археоботаника мәдени қабаттардағы көміртек қалдықтарын табуға мүмкіндік береді.
Параллельді түрде археозоологиялық зерттеулер жүргізілді. 941 жануар сүйегі есепке алынды. Олардың ішінде — ірі қара мал, қой, ешкі, жылқы, түйе, ит, бұғы, елік және құстардың қалдықтары бар. Ғалымдардың мәліметі бойынша, бұл тұрғындардың негізгі кәсібі мал шаруашылығы болғанын көрсетеді.
Қапал-Қызылағаш қалашығы Жетісу мен Ұлы Жібек жолы бойындағы елді мекендердің ортағасырлық тарихын зерттеу үшін маңызды.